北京新发地病毒源头初显端倪,认定欧洲直接输入为时尚早

导读

中疾控有关专家认为,笼统表述基因源自欧洲,这一说法容易造成新发地相关疫情的病毒是由欧洲输入直接导致的印象。据其透露,虽然从病毒遗传进化谱系上属于欧洲进化分支,但从东北内蒙输入病例引发的疫情也属欧洲分支

北京新发地病毒源头初显端倪,认定欧洲直接输入为时尚早

2020年6月13日,北京新发地市场全面封锁,所有品类的商品交易都已暂停。四天以来,北京疫情持续升级,4天已累计报道79例确诊病例。疫情形势陡变,拉紧了全国防控的神经。图/财新记者 蔡颖莉

文丨财新记者 赵今朝 马丹萌

四天以来,北京疫情持续升级,4天已累计报告79例确诊病例。疫情形势陡变,拉紧了全国防控的神经。病毒从何而来?财新记者了解到,根据目前的基因测序结果,在病毒遗传进化谱系上属于欧洲进化分支;但统称“源自欧洲”表述有专家指过于笼统,很容易出现歧义。

已公布的新增病例流调情况都将矛头直接或间接指向新发地农贸市场。“新发地批发市场是流调溯源的重中之重” ,北京市委宣传部副部长徐和建在北京新冠防控新闻发布会上表示。

在谈及北京新发地市场与武汉华南海鲜市场两次疫情的相似之处时,华山医院感染科主任张文宏对财新记者表示,两件事情表面看有相似之处,就是在拥挤不通风的市场内聚集性暴发。不同之处是本次首例患者的发病时间在6月初,一周内即被诊断,目前所有的病例都与新发地市场有关,属于防控早期。而武汉1月20日宣布人传人,已经离首发病例接近两个月了。

据财新记者了解,北京新一波疫情中,目前已经完成基因测序的样本病毒谱系情况基本一致。

病毒来自欧洲?

“通过全基因组测序发现病毒是从欧洲方向来的,初步判定与输入性有关来源。” 北京市疾控中心研究员杨鹏6月14日晚接受央视新闻采访时表示,北京新发地病毒溯源仍在进一步调查中,“病毒到底怎么来的,还无法确定。有可能是污染的海产品或肉类,或者进入市场的人通过分泌物进行传播。” 中国疾控中心流行病学原首席研究员曾光6月13日也公开表示,初步结果支持来自国外毒株,但样本数量较少。

“这是疾控部门专家一个科学的设想方向”,北京卫健委方面回应财新记者,科学界可以有各种想法,官方对外发布信息则比较慎重,“一定不要把专家的认识,代表卫健委的态度”。截至6月15日上午,北京市新冠疫情防控新闻发布会上尚未提及病毒来源相关内容。

中疾控有关专家认为,笼统表述基因源自欧洲,这一说法容易造成新发地相关疫情的病毒是由欧洲输入直接导致的印象。据其透露,虽然从病毒遗传进化谱系上属于欧洲进化分支,但从东北内蒙输入病例引发的疫情也属欧洲分支。

在此之前,黑龙江省牡丹江市也曾发生新冠疫情“复燃”,病毒即被认为来自欧洲。从5月25日至6月1日,牡丹江市陆续发现15例无症状感染者,并由此触发全市核酸筛查。牡丹江市长王文力在6月8日的新闻发布会上表示,经国家疾控中心(CDC)病毒基因测序比对,牡丹江市无症状感染者的病毒基因组属于L型欧洲家系,与该市下辖绥芬河口岸输入病例毒株最为相似。(详见财新网“牡丹江市区7天筛查超65万人 发现19名无症状感染者”)

新冠病毒目前没有公认分类,曾有剑桥大学研究者将新冠病毒分为A、B、C三型,其中A型与蝙蝠SARS-CoV-2病毒最接近,B型为武汉疫情主要病毒,C型则在欧洲地区新冠感染者中常见。该研究于4月发表在《美国国家科学院院刊》上,但饱受争议。

爱丁堡大学分子进化学教授安德鲁·兰巴特(Andrew Rambaut)完全不认同此论文的分析方法及所得结论,其在社交平台上连发状态,称这一研究从内容、结果到路径都有严重错误。此外,兰巴特曾表示,“病毒系统发生学的第一条规则:如果病毒的传播特性看起来不同,99%的情况是因为流行病学的关系”。他认为,仅仅是病毒输出并在别处导致大暴发,并不代表病毒行为发生了改变;某个病毒株系比其他株系更庞大,完全可能是偶然事件。

如何判断此轮新冠病毒属于哪一进化分支?有熟悉新冠病毒测序工作的研究人员告诉财新记者,由于每个地区流行的毒株都可能带有不同突变位点,理论上,分析病毒序列可以知道现有毒株与哪个地区流行的毒株最接近,从而判断其来源于哪个地区。

这些突变也可能影响病毒特性。如5月初在预印本网站bioRxiv上曾发表一篇与刺突蛋白(spike protein)突变相关论文,来自美国洛斯·阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory,LANL)的研究人员通过对GISAID数据库中4535个新冠病毒核酸序列分析,发现一种刺突蛋白D614突变为D614G的毒株,其传播力更强,于2月初开始在欧洲广泛传播,并在进入其他地区后也迅速成为当地主要毒株类型。但这一论文目前尚未经同行评议公开发表。

此前披露的牡丹江市无症状感染者具有一定传染性。在6月1日至7日筛查期间,牡丹江市区有超过65万人进行了核酸检测,筛查出19名无症状感染者。黑龙江省卫健委二级巡视员刘彦诚介绍称,在这19名无症状感染者中,有5人职业是装修从业人员,因有业务往来,几乎每天都在某固定场所聚集,有共同喝茶、吸烟和聚餐等行为,尽管均无症状,但在彼此间实现了“人传人”。

而武汉市也曾在5月进行过全员核酸检测,当时检测近990万人,检出无症状感染者300名,但据通报,没有发现无症状感染者传染他人的情况。

北京疾控初步的判定来自多少样本尚不清楚。有参与防控相关人士透露,已经检测的人,病毒情况都差不多。“测序几株是有区别的,已经能够看出来”,有传染病研究领域专家表示。

张文宏认为,疫情源头还需要更多的数据,需要详尽的现场流行病学材料和基因测序的全序列的数据。“现在判断为时过早。”

“溯源的事交给科学,一步一步来,”北京疾控相关人士表示,公共卫生的目的,就是把已经了解到的信息告知公众,让大家提高警惕。

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