新冠病毒正式命名SARS-CoV-2,与疾病不同名?

新京报快讯(记者 李玉坤)3月2日,《自然》杂志子刊《微生物学》发表了国际病毒分类学委员会冠状病毒研究小组关于新冠病毒分类和命名的共识文章,新冠病毒被正式命名为SARS-CoV-2,物种为SARS相关冠状病毒。

这篇论文此前以手稿的形式在预印本网站刊出。中科院武汉病毒所研究员石正丽、中国疾控中心主任高福等曾在柳叶刀官网发文反对这一命名方式,他们认为带有SARS的命名方式,会混淆“非典”(SARS)和新冠肺炎两种疾病。

记者发现,正式刊发的文章对于命名的规则和权威性重新进行了阐释。

命名原则是什么?

不一定与疾病有关,主要参考基因序列

论文指出,由于病毒无法用肉眼看见,从历史上看,与病毒相关的疾病和宿主范围成为了用来定义病毒的两个关键特征。这些都被称为病毒的表型特征(phenotype)。有些表型特征,比如疾病,是由病毒与宿主的相互作用所决定,例如传播速率或引发的免疫反应等;也有些由病毒本身特征所决定,例如病毒的结构。这些特征对于控制病毒(尤其是在严重疾病暴发期间)至关重要,并且主导着人们对病毒的普遍认知。

然而,对于一个特定的病毒来说,它的宿主可能是不确定的,很多病毒(包括大量冠状病毒)的致病性仍然未知。研究显示,自然界中传播的大量病毒,从未被在表型水平上描述过。

因此,基因组序列是绝大多数病毒已知的唯一特征,需要用于定义特定病毒。

在这个前提下,病毒是由能够在适当条件下在细胞内自主复制并在细胞或生物之间传播的基因组序列定义的。它可能对自然宿主有害,也可能无害。实验研究只对一部分已知病毒适用,分析比较基因组的方法可以对所有病毒进行分类(并推断其特征)。因此,病毒命名不一定与疾病有关,而是应该参考其他特征。

论文表示,RNA病毒的分类需要考虑其固有的遗传变异性,两种或更多种病毒具有不同但相似的基因组序列被视为同一病毒的变异体。

为何由CSG来命名?

作为“官方”职权的延伸

发表论文并对新冠病毒进行命名的是国际病毒分类学委员会(ICTV )的冠状病毒研究小组(CSG)。参与论文的十几名成员多来自欧美研究机构,亚洲研究机构只有一人,来自香港大学。

谁可以命名新发现的病毒?国际病毒分类学委员会(ICTV)给媒体的回复称,命名病毒不需要官方批准。命名通常由病毒的发现者完成,但偶尔也会得到一个专家委员会的协助。只要科学界接受并使用这个名称,它就会成为事实上的标准。

在正式发表的命名文章中,作者解释,国际病毒分类学委员会(ICTV)成立50年来,为病毒确定通用名称一直是它的主要任务。当病毒分类学中物种的等级建立后,国际病毒分类学委员会(ICTV)的职责已经转移到命名和确定病毒物种。不过,委员会下面的研究小组利用其成员的专业知识,还可以参与每一个病毒命名,以此作为其“官方”职权范围的延伸。

论文还解释,冠状病毒研究小组(CSG)在国际病毒分类学委员会(ICTV)的监督下,建立了一套独特的分类单元命名法,能够在菌株或分离株的水平上对基因组变异进行划分。但他们强调,各病毒研究小组在病毒分类方法上是独立的,用于定义一个病毒科(例如冠状病毒科)中病毒物种的标准可能不适用于其他科,例如逆转录病毒科,反之亦然。

新冠病毒为何“不配”有姓名?

并非是新物种中首个被识别出的代表

冠状病毒科属于RNA病毒,套式病毒目,目前有2个亚科,5个属,27个亚属,39种病毒。SARS相关冠状病毒是39种病毒之一。显然,这一物种名称来源于SARS。

SARS-CoV和MERS-CoV两种冠状病毒也是21世纪之后发现能够感染人类的。此前,冠状病毒研究小组将这两种病毒作为Beta冠状病毒属下面两种亚组的原型物种,当病毒分类学建立亚属等级后,这两个亚组被命名为Sarbecovirus和Merbecovirus。作为新物种首个被分离出来的病毒,SARS病毒和MERS病毒就“代言”了它们的物种名和亚属名。但是新冠病毒的“待遇”就没有这么特殊了,因为新冠病毒属于一个现有物种,这个物种包含数百种从人类和各种蝙蝠中分离出的已知病毒。

作者根据病毒的系统发育树判定,新冠病毒属于SARS相关冠状病毒这一“物种”,它和SARS病毒的关系是并列的、姊妹病毒,二者没有进化关系。

新冠病毒正式命名SARS-CoV-2,与疾病不同名?

冠状病毒的系统发育树。

作者用人的物种学分类进行了对比,SARS相关冠状病毒相当于智人这一物种,SARS病毒毒株和新冠病毒毒株都是这一物种下面并列的“个体”。众所周知,人类也分为不同的人种,但不存在生殖隔离。

新冠病毒正式命名SARS-CoV-2,与疾病不同名?

SARS相关冠状病毒分类法(与人的物种学分类法对比)。

论文解释了如何规范书写种名和具体病毒的名称,因为某个病毒物种的名称通常与这个物种最早发现的病毒名称非常相似,所以在文章中经常混淆。作者称,物种名称应该用斜体显示,大写字母开头,并且不能缩写。比如,SARS相关冠状病毒这一物种应该书写为Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus。但是病毒名称不用,比如引发非典的病毒可以写为SARS-CoV。

疾病和病毒名不一样?

可以“降低混淆病毒和疾病的风险”

论文称,世界卫生组织(WHO)是联合国的一个机构,负责命名由病毒引起的新的疾病,此前,经常将特定疾病的名称与病毒联系起来(比如SARS病毒和SARS,MERS病毒和MERS)。

这次,世卫组织(WHO)将新型冠状病毒感染引起的疾病正式命名“COVID-19”。总干事谭德塞解释,这个短语代表了2019年冠状病毒病,其中CO代表Corona(冠状物),VI代表Virus(病毒),D代表Disease(疾病)。“这(COVID-19的命名)也为我们提供了一种标准格式,可用于将来的任何冠状病毒引发的疾病。”

这样一来,疾病的名称和引发疾病的病毒名称就不一致了。这也是很多中国学者希望能将病毒重新命名的原因。石正丽等人就建议将新冠病毒命名为人类冠状病毒2019(HCoV-19),与SARS-CoV区别开来,并与世卫组织对疾病的命名COVID-19保持一致。

但在冠状病毒研究小组正式发表的命名论文中,作者认为,二者不一致恰好能够降低混淆病毒和疾病的风险。

新冠病毒正式命名SARS-CoV-2,与疾病不同名?

国际病毒分类学委员会(ICTV)冠状病毒研究小组(CSG)对病毒的命名,和世界卫生组织(WHO)对疾病的命名。

论文作者表示,新冠病毒的疾病谱和传输效率与SARS病毒不同,用于确认新冠病毒感染的诊断方法与SARS的诊断方法也不相同。为了适应由新冠病毒引起的临床表现和感染结果,世卫组织最近引入了一个不太具体的名称(COVID-19)表示这种疾病。

将病毒和由病毒引发的疾病分开命名,冠状病毒研究小组的目的是支持世卫组织用最恰当的方式命名疾病,也希望此举能够提高公众和公共卫生当局对这两个实体之间差异的认识,帮助加强疫情管理,并降低混淆病毒和疾病的风险,不要像多年来SARS-CoV(病毒)和SARS(疾病)那样。

新京报记者 李玉坤

编辑 丁天 校对 危卓

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