中国科研团队:新冠病毒已突变 演化出2个亚型

近日,中国科学院主办的《国家科学评论》发表一篇名为《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》的研究论文称,发现新冠病毒已于近期产生了149个突变点,并演化出了两个亚型——L亚型和S亚型,在地域分布及人群中的比例,这两个亚型表现出了很大测差异。其中S型是相对更古老的版本,而L亚型更具侵略性传染力更强。对不同亚型的深入了解,将有助于新冠肺炎的差异化的治疗和防控。

研究发现新冠病毒演化出两个亚型

论文通过对目前为止最大规模的103个新冠病毒全基因组分子进化分析,发现病毒株已发生了149个突变点,而且多数是近期产生的。该研究揭示:新冠病毒已经演化出L和S两个亚型。其中101个属于这两个亚型。从占比上看,L亚型更为普遍达到70%,S亚型占30%。

论文作者认为,根据新型冠状病毒的演变方式推测,L亚型和S亚型的传播能力、致病严重程度或许存在较大区别。

论文称,两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点,L亚型是T碱基(对应亮氨酸,Leu),S亚型是C碱基(对应丝氨酸,Ser)。通过与其他冠状病毒比较,作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近,从而得出S型相对更古老的结论。

L亚型在武汉爆发的早期阶段更为普遍,而L亚型的发生频率在2020年1月初后有所下降。作者认为,人为干预可能对L亚型施加了更大的选择性压力,如果没有这些干预,L亚型可能更具侵略性和扩散得更快速。另一方面,由于选择压力相对较弱,在进化上较老且攻击性较小的S型可能在相对频率上有所增加。这些发现意味着,目前迫切需要结合基因组数据、流行病学数据和2019年冠状病毒病患者临床症状图表记录,进行进一步的全面研究。

另外,值得注意的是,这103个样本显示,大部分患者只感染了L亚型或S亚型中的一个。但其中一位近期有过武汉旅行史的美国患者分离出的病毒株,这两个位点却均呈现了C和T的混合现象,也就是说,很有可能这位患者同时感染了L型和S型新冠病毒。不过,作者表示目前还无法排除新突变型的可能性。

巴西发现的新冠病毒与中国有所不同,患者病毒基因有3处突变

巴西在2月26日出现首例确诊病例。当地科学家与英国科学家合作,紧急针对该名61岁的巴西患者进行“冠状病毒基因定序”,结果发现这名患者体内的新冠病毒同武汉公布的病毒基因相比存在3处不同,表示病毒在传播过程中已经发生突变。

据南方都市报,3月1日,一份发表在病毒学国际交流平台(Virological),题为《First report of COVID-19 in South America》(南美洲首例新型冠状病毒报告)引发关注,这是南美洲首次分析出新冠病毒的基因序列,由巴西Adolfo Lutz国家研究所、国家参考实验室,以及圣保罗大学(USP)、牛津大学热带医学研究所共同完成。

据报告介绍,该名巴西首例确诊新冠肺炎患者为61岁男性,来自圣保罗市。他于2020年2月9-21日,曾前往意大利北部的伦巴第旅游。在返回巴西后,他出现发烧和呼吸道症状,包括干咳、喉咙痛、流鼻涕等。2月25日,他在圣保罗阿尔伯特·爱因斯坦医院进行了新冠肺炎的诊断筛查,26日确诊为新冠肺炎患者。

研究人员从该名患者的鼻咽中提取病毒基因,进行“冠状病毒基因定序”,原本需要花15天的工程,在48小时内完成。

报告指出,初步的遗传分析表明,这株巴西“Brazil/SPBR1/2020”病毒的基因组,跟中国此前公布的 “Hu-1参考菌株”有3处不同,表示病毒在传播的过程中已经开始突变。而这些突变中,有两处跟德国慕尼黑群聚传染事件中提取的病毒“德国/ BavPat1/2020菌株”非常接近。这个结果表示,在欧洲传播的新冠病毒已经跟原本在中国传播的病毒有所不同。

另据看看新闻,研究团队表示,目前意大利只公布了一个病毒基因组序列,来自一位东亚地区的女游客,属于 “境外输入病毒 ”。但随着确诊病例越来越多,有必要针对意大利本土病例重新进行病毒分析。“意大利北部的伦巴第地区,正好是出现第一例意大利本土病例的地方,所以我们分析的病毒基因或许可以代表新的发现,包括病毒的变异。”

研究团队将这份资料公开,希望各国能共享研究成果,避免病毒在大家不清楚其已变异的情况下传播,引发更多不确定的突变。

文章综合自每日新闻、环球时报、澎湃新闻

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