相似度96%!武汉病毒所石正丽团队研究表明:新型冠状病毒最可能宿主还是蝙蝠

相似度96%!武汉病毒所石正丽团队研究表明:新型冠状病毒最可能宿主还是蝙蝠相似度96%!武汉病毒所石正丽团队研究表明:新型冠状病毒最可能宿主还是蝙蝠

2020年1月22日,北京大学、广西中医药大学、宁波大学及武汉生物工程学院联合攻关,在Journal of Medical Virology杂志发表题为:Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human 的研究论文,该研究发现蛇是造成当前武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)感染爆发的最可能的野生动物库。(不是蝙蝠!最新研究表明,武汉新型冠状病毒来自蛇,再次提醒大家不要再吃野生动物!)。然而,仅仅一天之后的2020年1月23日,中科院武汉病毒所石正丽团队在预印本网站 BioRxiv在线发表题为:Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin 的研究论文。该研究对先前的结果提出了新的挑战,认为蝙蝠才是最有可能的携带武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)的野生动物。

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石正丽团队成员,中间为石正丽教授

2017年,正是石正丽团队的研究揭示非典SARS病毒的真正来源是云南的中华菊头蝠。

2017年11月30日,石正丽团队在国际病原学权威期刊PLoS Pathogens 杂志上发表了题为:Discoveryof a rich gene pool of bat SARS related coronaviruses provides new insights intothe origin of SARS coronavirus 的研究论文。该团队在我国云南发现了一处蝙蝠SARS样冠状病毒的天然基因库,揭示SARS冠状病毒起源于蝙蝠中的病毒重组。

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石正丽团队在中国各个省份采集了数千只中华菊头蝠(Chinese horseshoe bats)标本,并对其体内病毒进行基因组分析。最终他们在云南省一个偏僻的洞穴中,发现了一群携带有SARS样冠状病毒的中华菊头蝠,通过测序及序列比对,研究团队发现该SARS样冠状病毒与2003年爆发的SARS病毒具有高度同源性。

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此外,研究人员对蝙蝠洞附近村庄的村民进行了病毒抗体筛查发现,不少村民体内存在SARS样冠状病毒的相关抗体,表明这些SARS样冠状病毒可以感染人体(不会引起较大症状)。因此,研究团队证实SARS病毒很可能起源于这些SARS样冠状病毒的混合重组。中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队成功证实蝙蝠是SARS冠状病毒的自然宿主,并首次在我国蝙蝠体内检测到烈性病毒尼帕病毒和埃博拉病毒抗体,发现多个蝙蝠携带的新病毒。这些研究开创了我国系统研究蝙蝠病毒的先河,对动物源新发病毒病原学、新病毒发现等研究方向的发展起到了积极推动作用。石正丽也因此被称为“蝙蝠女侠”,石正丽团队也成为国际蝙蝠病毒研究领域最有影响力的实验室之一。

此次石正丽团队关于武汉新型冠状病毒的研究结论,主要基于3个证据:

1.该研究用的是临床病人的第一手临床样本做的测序,发现2019-nCoV病毒与SARSr-CoV有79.5%的序列相似性;

2.该研究用自己的数据做了进化树分析发现应该还是蝙蝠来源的:在整个基因组水平上,2019-nCoV与蝙蝠冠状病毒的同源性为96%;

3.该研究从分子水平揭示了2019-nCoV利用的是ACE2分子,与SARS-CoV使用相同的细胞进入受体ACE2。

这项研究提供了有关2019-nCoV的第一份详细报告,2019-nCoV是造成中国中部武汉市持续性急性呼吸道综合症流行的病因。在此阶段,我们对病毒知之甚少,包括基本生物学,动物来源或任何特定治疗方法。

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自18年前的SARS爆发以来,在其自然的宿主蝙蝠中发现了大量与严重急性呼吸系统综合症相关的冠状病毒(SARSr-CoV)。先前的研究表明,其中一些蝙蝠SARSr-CoV具有感染人类的潜力。

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2019-nCoV的基因组表征

在这里,研究人员报告了一种新型冠状病毒(2019-nCoV)的鉴定和表征,该冠状病毒在中国武汉引起了人类急性呼吸道综合症的流行。该流行病始于2019年12月12日,到2020年1月20日已导致198例实验室确认的感染,其中3例死亡。

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患者样本的分子和血清学研究

在爆发初期,研究人员从5名患者中获得了全长基因组序列。它们彼此几乎相同,并且对SARS-CoV共有79.5%的序列相似性。此外,发现在整个基因组水平上,nCoV-2019与蝙蝠冠状病毒的同源性为96%。

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病毒颗粒

七个保守的非结构蛋白的成对蛋白序列分析表明,该病毒属于SARSr-CoV物种。然后从重症患者的支气管肺泡灌洗液中分离出2019-nCoV病毒,该病毒可被几名患者的血清中和。重要的是,该研究已经确认,这种新型冠状病毒与SARS-CoV使用相同的细胞进入受体ACE2。

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2019-nCoV受体使用情况分析

总而言之,这项研究提供了有关2019-nCoV的第一份详细报告,2019-nCoV是造成中国中部武汉市持续性急性呼吸道综合症流行的病因。在所有接受测试的151例患者中观察到150例病毒特异性核苷酸阳性和病毒蛋白血清转化,提供了该疾病与病毒之间存在关联的证据。根据该研究结果,应该预期并且值得测试ACE2靶向药物或SARS-CoV靶向药物是否可用于2019-nCoV患者。在此阶段,我们对病毒知之甚少,包括基本生物学,动物来源或任何特定治疗方法。真理总是越辩越明,我们一起关注后续研究进展,共克时艰。论文链接:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jmv.25682

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v1

来源:BioWorld授权转载 本文部分内容来自:iNature

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